Audit Operasi dijalankan untuk memeriksa mengenai penggunaan sumber-sumber jabatan untuk dinilai samada sumber-sumber tersebut telah digunakan secara efisyen dan efektif bagi mematuhi misi dan objektif jabatan / Majlis. Juruaudit lebih menitikberatkan tentang siapa, apa, bila, kenapa dan bagaimana dalam menjalankan operasi yang lebih efisyen dan efektif daripada aspek-aspek perakaunan dan kewangan.

Auditan dijalankan dalam tempoh 21 hari bekerja dan laporan disiapkan dalam tempoh 7 hari bekerja.