Audit Penyiasatan dijalankan jika terdapat permintaan daripada pegawai jabatan atau pihak pengurusan pentadbiran. Audit ini difokuskan terhadap perakaunan dan kelakuan penyelewengan bagi memastikan samada berlaku pencabulan undang-undang sivil atau jenayah serta melanggari polisi dan peraturan Majlis. Alasan untuk audit penyiasatan termasuklah kecurian dalaman, penyalahgunaan aset Majlis serta penyalahgunaan kuasa.

Auditan dijalankan dalam tempoh 21 hari bekerja dan laporan disiapkan dalam tempoh 7 hari bekerja.